MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 4771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009508	CAG	2	6	22	27	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550846
2	NC_009508	ACC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550846
3	NC_009508	GCA	2	6	213	218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550846
4	NC_009508	CCCG	2	8	284	291	0 %	0 %	25 %	75 %	148550846
5	NC_009508	GCT	2	6	353	358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550846
6	NC_009508	GCA	2	6	434	439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550846
7	NC_009508	CAT	2	6	441	446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550846
8	NC_009508	TCG	2	6	522	527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550846
9	NC_009508	ATCA	2	8	553	560	50 %	25 %	0 %	25 %	148550846
10	NC_009508	GCG	2	6	608	613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550846
11	NC_009508	CCG	2	6	636	641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550846
12	NC_009508	CGC	2	6	867	872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550846
13	NC_009508	GCC	2	6	914	919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550846
14	NC_009508	CAG	2	6	994	999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550846
15	NC_009508	AAC	2	6	1055	1060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550846
16	NC_009508	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550846
17	NC_009508	AGCG	2	8	1111	1118	25 %	0 %	50 %	25 %	148550846
18	NC_009508	GTC	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550846
19	NC_009508	GC	3	6	1155	1160	0 %	0 %	50 %	50 %	148550846
20	NC_009508	ACGG	2	8	1183	1190	25 %	0 %	50 %	25 %	148550846
21	NC_009508	GAT	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550847
22	NC_009508	GCC	2	6	1317	1322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550847
23	NC_009508	TGA	3	9	1358	1366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550847
24	NC_009508	ACA	2	6	1372	1377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550847
25	NC_009508	GT	3	6	1438	1443	0 %	50 %	50 %	0 %	148550847
26	NC_009508	CGA	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550847
27	NC_009508	GGTCA	2	10	1575	1584	20 %	20 %	40 %	20 %	148550847
28	NC_009508	CGC	2	6	1592	1597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550847
29	NC_009508	TGA	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550847
30	NC_009508	CCA	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550847
31	NC_009508	GTA	2	6	1812	1817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550847
32	NC_009508	GCC	2	6	1846	1851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550847
33	NC_009508	TTC	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550847
34	NC_009508	AGT	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550848
35	NC_009508	T	6	6	1903	1908	0 %	100 %	0 %	0 %	148550848
36	NC_009508	TCG	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550848
37	NC_009508	ACG	2	6	1935	1940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550848
38	NC_009508	CTTCGA	2	12	2008	2019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148550848
39	NC_009508	GC	3	6	2063	2068	0 %	0 %	50 %	50 %	148550848
40	NC_009508	CCG	2	6	2092	2097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550848
41	NC_009508	GC	3	6	2103	2108	0 %	0 %	50 %	50 %	148550848
42	NC_009508	TCA	3	9	2163	2171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550848
43	NC_009508	CCG	2	6	2247	2252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550848
44	NC_009508	TGC	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550848
45	NC_009508	ATC	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550848
46	NC_009508	TTG	2	6	2421	2426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550848
47	NC_009508	CCA	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550848
48	NC_009508	ATG	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550848
49	NC_009508	TGA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550849
50	NC_009508	ACA	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550849
51	NC_009508	GT	3	6	2752	2757	0 %	50 %	50 %	0 %	148550849
52	NC_009508	CAT	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550849
53	NC_009508	GGGAT	2	10	2864	2873	20 %	20 %	60 %	0 %	148550849
54	NC_009508	CACG	2	8	2894	2901	25 %	0 %	25 %	50 %	148550849
55	NC_009508	CCCG	2	8	2934	2941	0 %	0 %	25 %	75 %	148550849
56	NC_009508	TCC	2	6	2957	2962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550849
57	NC_009508	TAA	2	6	2978	2983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550849
58	NC_009508	TCG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550849
59	NC_009508	CGA	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550849
60	NC_009508	GGC	2	6	3119	3124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550849
61	NC_009508	GGT	2	6	3148	3153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550849
62	NC_009508	GGT	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550849
63	NC_009508	CCA	2	6	3192	3197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550849
64	NC_009508	ACA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550849
65	NC_009508	CGC	2	6	3286	3291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550849
66	NC_009508	CTGC	2	8	3437	3444	0 %	25 %	25 %	50 %	148550849
67	NC_009508	GCA	2	6	3455	3460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550849
68	NC_009508	CT	3	6	3461	3466	0 %	50 %	0 %	50 %	148550849
69	NC_009508	TCT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009508	CATG	2	8	3533	3540	25 %	25 %	25 %	25 %	148550850
71	NC_009508	GTC	2	6	3559	3564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550850
72	NC_009508	AACG	2	8	3568	3575	50 %	0 %	25 %	25 %	148550850
73	NC_009508	TGC	2	6	3613	3618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550850
74	NC_009508	GCGA	2	8	3653	3660	25 %	0 %	50 %	25 %	148550850
75	NC_009508	GGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550850
76	NC_009508	CG	3	6	3724	3729	0 %	0 %	50 %	50 %	148550850
77	NC_009508	ACG	2	6	3791	3796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550850
78	NC_009508	TG	3	6	3798	3803	0 %	50 %	50 %	0 %	148550850
79	NC_009508	CA	3	6	3891	3896	50 %	0 %	0 %	50 %	148550850
80	NC_009508	CAA	2	6	3969	3974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550850
81	NC_009508	CTT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550850
82	NC_009508	TGG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550850
83	NC_009508	CCG	3	9	4286	4294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550850
84	NC_009508	CG	3	6	4373	4378	0 %	0 %	50 %	50 %	148550850
85	NC_009508	CAG	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550850
86	NC_009508	GCC	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550850
87	NC_009508	TGAA	2	8	4553	4560	50 %	25 %	25 %	0 %	148550850
88	NC_009508	CGAC	2	8	4566	4573	25 %	0 %	25 %	50 %	148550850
89	NC_009508	CGT	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550851
90	NC_009508	GCCA	2	8	4673	4680	25 %	0 %	25 %	50 %	148550851
91	NC_009508	ATG	2	6	4699	4704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550851
92	NC_009508	GC	4	8	4726	4733	0 %	0 %	50 %	50 %	148550851
93	NC_009508	CCG	3	9	4781	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550851
94	NC_009508	CGGCAC	2	12	4799	4810	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148550851
95	NC_009508	AGC	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550851
96	NC_009508	CGT	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550851
97	NC_009508	CCAG	2	8	4880	4887	25 %	0 %	25 %	50 %	148550851
98	NC_009508	TG	3	6	4889	4894	0 %	50 %	50 %	0 %	148550851
99	NC_009508	AT	3	6	4924	4929	50 %	50 %	0 %	0 %	148550851
100	NC_009508	CCG	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550851
101	NC_009508	CAT	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550851
102	NC_009508	GC	3	6	5031	5036	0 %	0 %	50 %	50 %	148550851
103	NC_009508	TCGC	2	8	5053	5060	0 %	25 %	25 %	50 %	148550851
104	NC_009508	CG	3	6	5144	5149	0 %	0 %	50 %	50 %	148550851
105	NC_009508	GCTT	2	8	5174	5181	0 %	50 %	25 %	25 %	148550851
106	NC_009508	GCG	2	6	5236	5241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550851
107	NC_009508	CCGC	2	8	5293	5300	0 %	0 %	25 %	75 %	148550851
108	NC_009508	GAT	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550851
109	NC_009508	ATCG	2	8	5463	5470	25 %	25 %	25 %	25 %	148550851
110	NC_009508	CG	4	8	5577	5584	0 %	0 %	50 %	50 %	148550851
111	NC_009508	GC	3	6	5612	5617	0 %	0 %	50 %	50 %	148550851
112	NC_009508	CCA	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550851
113	NC_009508	GAA	2	6	5646	5651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550851
114	NC_009508	CG	3	6	5713	5718	0 %	0 %	50 %	50 %	148550851
115	NC_009508	TTGC	2	8	5757	5764	0 %	50 %	25 %	25 %	148550851
116	NC_009508	CTCG	2	8	5853	5860	0 %	25 %	25 %	50 %	148550851
117	NC_009508	GGC	2	6	5870	5875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550851
118	NC_009508	GAA	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550851
119	NC_009508	ACAT	2	8	5890	5897	50 %	25 %	0 %	25 %	148550851
120	NC_009508	AG	3	6	6061	6066	50 %	0 %	50 %	0 %	148550851
121	NC_009508	CGG	2	6	6091	6096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550851
122	NC_009508	CCA	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550851
123	NC_009508	CTT	2	6	6246	6251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550851
124	NC_009508	GCA	2	6	6263	6268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550851
125	NC_009508	CAAC	2	8	6327	6334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009508	CGGGG	2	10	6383	6392	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009508	G	10	10	6389	6398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009508	ATT	2	6	6402	6407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009508	TAA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009508	GGA	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009508	TCAA	2	8	6517	6524	50 %	25 %	0 %	25 %	148550852
132	NC_009508	TTG	2	6	6527	6532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550852
133	NC_009508	TCG	2	6	6608	6613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550852
134	NC_009508	AAG	2	6	6622	6627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550852
135	NC_009508	AGG	2	6	6649	6654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550852
136	NC_009508	CCG	2	6	6710	6715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550852
137	NC_009508	TAT	2	6	6744	6749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148550852
138	NC_009508	TAT	2	6	6841	6846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009508	GA	3	6	6856	6861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009508	AGG	2	6	6882	6887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009508	TAC	2	6	7012	7017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550853
142	NC_009508	GCC	2	6	7058	7063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550853
143	NC_009508	TCA	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550853
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145	NC_009508	GGAA	2	8	7182	7189	50 %	0 %	50 %	0 %	148550853
146	NC_009508	CTG	2	6	7209	7214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550853
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158	NC_009508	AC	3	6	8008	8013	50 %	0 %	0 %	50 %	148550853
159	NC_009508	GCA	2	6	8088	8093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550853
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164	NC_009508	GC	3	6	8231	8236	0 %	0 %	50 %	50 %	148550853
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246	NC_009508	CG	3	6	12727	12732	0 %	0 %	50 %	50 %	148550857
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256	NC_009508	GCG	2	6	13085	13090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550857
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267	NC_009508	CGC	2	6	13592	13597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_009508	CAA	2	6	13620	13625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_009508	CG	3	6	13676	13681	0 %	0 %	50 %	50 %	148550858
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396	NC_009508	CGC	2	6	19751	19756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550864
397	NC_009508	GC	3	6	19779	19784	0 %	0 %	50 %	50 %	148550864
398	NC_009508	GCA	2	6	19808	19813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550864
399	NC_009508	TTC	2	6	19843	19848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550864
400	NC_009508	CCAGCC	2	12	19880	19891	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148550864
401	NC_009508	CA	3	6	19931	19936	50 %	0 %	0 %	50 %	148550864
402	NC_009508	GAT	2	6	19971	19976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550864
403	NC_009508	ATC	2	6	19987	19992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550864
404	NC_009508	TCGA	2	8	20002	20009	25 %	25 %	25 %	25 %	148550864
405	NC_009508	TAA	2	6	20029	20034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550864
406	NC_009508	TCGA	2	8	20077	20084	25 %	25 %	25 %	25 %	148550864
407	NC_009508	GAT	2	6	20093	20098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550864
408	NC_009508	CGG	2	6	20100	20105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550864
409	NC_009508	CAT	2	6	20166	20171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550864
410	NC_009508	ATC	2	6	20175	20180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_009508	CAA	2	6	20239	20244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_009508	TGATC	2	10	20255	20264	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
413	NC_009508	GCC	2	6	20292	20297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550865
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415	NC_009508	ATC	2	6	20364	20369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550865
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418	NC_009508	TGC	2	6	20518	20523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550865
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420	NC_009508	AT	3	6	20582	20587	50 %	50 %	0 %	0 %	148550865
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429	NC_009508	TCAC	2	8	20994	21001	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
430	NC_009508	CCG	2	6	21021	21026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
431	NC_009508	ACC	2	6	21050	21055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
432	NC_009508	CGC	2	6	21065	21070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
433	NC_009508	GGC	2	6	21074	21079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_009508	CAG	2	6	21089	21094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_009508	GCCC	2	8	21168	21175	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
436	NC_009508	AC	3	6	21176	21181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
437	NC_009508	GAG	2	6	21343	21348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
438	NC_009508	CGA	2	6	21366	21371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_009508	GAA	2	6	21432	21437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_009508	GCGG	2	8	21589	21596	0 %	0 %	75 %	25 %	148550866
441	NC_009508	CGAG	2	8	21605	21612	25 %	0 %	50 %	25 %	148550866
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467	NC_009508	CA	3	6	22928	22933	50 %	0 %	0 %	50 %	148550868
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474	NC_009508	TCA	3	9	23292	23300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_009508	GTG	2	6	23319	23324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
476	NC_009508	GAT	2	6	23345	23350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_009508	GAG	2	6	23448	23453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_009508	ATC	2	6	23553	23558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550869
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500	NC_009508	GCGCC	2	10	24482	24491	0 %	0 %	40 %	60 %	148550869

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